De organisatie achter CIRE is de Stichting Integriteit en Transparantie Energieadvies (SITE): een gremium van energieleveranciers en distributieplatformen.

SITE wordt geleid door een vijfkoppig bestuur dat begin 2020 is aangetreden. Het bestuur is verantwoordelijk voor het beleid, doet woordvoering op dossier en onderhoudt de contacten met maatschappelijke stakeholders, zoals de toezichthouder.

De Raad van Toezicht houdt met 13 leden toezicht op de realisatie van beleidsdoelstellingen. Het dagelijkse beheer van het CIRE-register en de uitvoering van beleid is in handen van een derde organisatie, TQIS, die dienst doet als beheerder van het register.